“候鸟e人”的故事主线，聚焦于一群热衷于保护候鸟生态的年轻人，讲述了一段始于舄湖湿地的浪漫爱情故事。这部作品的情节发展，如同候鸟在不同季节的迁徙轨迹，从七股到关渡，从马祖的孤岛直至繁华的台北街头。小青、邵韩与湘子，三人心灵相通，形影不离。然而，在追求唯一爱情的路上，他们不得不面对个人身份与城市生活的抉择。鸟人与黑琵在虚拟的网络世界中相遇，又在现实生活里重逢。邵韩与小青在七股赏鸟的旅途中不期而遇，因一次碰撞结缘。他们彼此间的矛盾与冲突，邵韩的好友小汪也对小青心生爱慕。当两人终于在现实世界中相识，爱情与友情的抉择成为难题。而邵韩误以为已故的初恋女友湘子仍在人世，过去的情感纠葛、愧疚与责任，以及新旧爱之间的挣扎，让他陷入两难。至情至性的他，又将如何作出选择？暗中爱慕小汪的丁丁，以及痴心等待丁丁的小谢，他们的故事又将如何发展？